Protein–RNA interactions for Protein: P26368

U2AF2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF2P26368 FHIT-205ENST00000476844 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 INTS9-201ENST00000416984 2759 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.083e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 NLRC5-228ENST00000545081 5832 ntTSL 214.35□□□□□ -0.113e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.123e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 STK40-206ENST00000460417 681 ntTSL 214.28□□□□□ -0.123e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 AC008575.2-201ENST00000503445 506 ntTSL 314.22□□□□□ -0.133e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 INTS9-212ENST00000521070 682 ntTSL 314.12□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 NLRC5-211ENST00000538110 2656 ntTSL 514.07□□□□□ -0.163e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 DMAP1-206ENST00000437511 957 ntTSL 313.99□□□□□ -0.173e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 NLRC5-214ENST00000538778 1019 ntTSL 313.86□□□□□ -0.193e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 MBTD1-202ENST00000405860 3224 ntTSL 513.8□□□□□ -0.23e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 FAN1-201ENST00000362065 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.23e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 NLRC5-216ENST00000538930 1686 ntTSL 513.69□□□□□ -0.223e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 FHIT-204ENST00000468189 1634 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.243e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 PLOD1-201ENST00000196061 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.243e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 AC008575.2-202ENST00000506997 1643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.283e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 DMAP1-213ENST00000487922 862 ntTSL 313.21□□□□□ -0.293e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 DMAP1-210ENST00000471829 874 ntTSL 313.21□□□□□ -0.293e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 ATXN10-212ENST00000640901 1185 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.333e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 ZC3HAV1-201ENST00000242351 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.343e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 WDR27-212ENST00000546953 3175 ntTSL 212.71□□□□□ -0.383e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 INTS9-213ENST00000521777 2430 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.43e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 NLRC5-203ENST00000436936 6724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.423e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 LINC00174-208ENST00000450353 1303 ntTSL 512.41□□□□□ -0.423e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 FHIT-206ENST00000488467 601 ntTSL 312.41□□□□□ -0.423e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 KLHL24-205ENST00000454652 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.439e-12■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 INTS9-211ENST00000521022 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.433e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 NLRC5-209ENST00000537056 3430 ntTSL 1 (best)12.21□□□□□ -0.463e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 NLRC5-213ENST00000538453 4121 ntTSL 212.14□□□□□ -0.473e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 DLST-215ENST00000557012 698 ntTSL 212.12□□□□□ -0.473e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 DLST-212ENST00000556190 565 ntTSL 412.12□□□□□ -0.473e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 COPS6-208ENST00000474823 752 ntTSL 211.91□□□□□ -0.53e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 DMAP1-209ENST00000463950 550 ntTSL 211.89□□□□□ -0.513e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 NLRC5-219ENST00000540182 3617 ntTSL 1 (best)11.86□□□□□ -0.513e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 TRMU-213ENST00000485175 731 ntTSL 511.82□□□□□ -0.523e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 REPS1-204ENST00000414243 578 ntTSL 311.78□□□□□ -0.523e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 NLRC5-217ENST00000539144 6505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.533e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 LINC00174-201ENST00000412091 682 ntTSL 511.68□□□□□ -0.543e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 NLRC5-201ENST00000262510 6822 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.573e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 INTS9-217ENST00000523303 2578 ntTSL 1 (best)11.4□□□□□ -0.583e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 STK40-207ENST00000473733 629 ntTSL 311.39□□□□□ -0.593e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 ZC3HAV1-202ENST00000460845 1487 ntTSL 1 (best)11.34□□□□□ -0.593e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 HERC1-212ENST00000561348 588 ntTSL 211.33□□□□□ -0.61e-8■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 SRP19-204ENST00000505459 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.643e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 NLRC5-215ENST00000538805 3552 ntTSL 210.96□□□□□ -0.663e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 PIP4K2A-203ENST00000422321 768 ntTSL 310.78□□□□□ -0.683e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 FAM199X-202ENST00000493442 7457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.692e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 UBAP1L-204ENST00000561387 7377 ntTSL 1 (best)10.64□□□□□ -0.713e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 NBR1-203ENST00000585505 3295 ntTSL 210.4□□□□□ -0.743e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 COPS6-204ENST00000426712 716 ntTSL 39.71□□□□□ -0.863e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 UBR1-204ENST00000563239 545 ntTSL 39.67□□□□□ -0.863e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 AL603839.3-201ENST00000450713 605 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.883e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 INTS9-215ENST00000522363 2045 ntTSL 29.44□□□□□ -0.93e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 PIP5K1A-216ENST00000486866 600 ntTSL 39.28□□□□□ -0.923e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 DMAP1-204ENST00000372290 396 ntTSL 59.28□□□□□ -0.923e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 PIP5K1A-210ENST00000460157 554 ntTSL 49.28□□□□□ -0.923e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 FKBP15-203ENST00000446284 8807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)8.54□□□□□ -1.043e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 NXF1-212ENST00000531872 390 ntTSL 58.47□□□□□ -1.059e-10■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 ZFYVE9-205ENST00000469134 859 ntTSL 38.22□□□□□ -1.093e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.153e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.213e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 HERC4-210ENST00000480158 2438 ntTSL 27.34□□□□□ -1.233e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 PPIL1-202ENST00000483552 1347 ntTSL 27.26□□□□□ -1.253e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 REPS1-206ENST00000431346 838 ntTSL 57.24□□□□□ -1.253e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.293e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 COPS6-209ENST00000483891 734 ntTSL 36.84□□□□□ -1.313e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 TET2-201ENST00000265149 9588 ntTSL 56.58□□□□□ -1.363e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 AC008575.2-204ENST00000509024 474 ntTSL 26.29□□□□□ -1.43e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.473e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 HERC1-213ENST00000561359 551 ntTSL 35.85□□□□□ -1.471e-8■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 TRMU-217ENST00000493556 432 ntTSL 35.71□□□□□ -1.53e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 MBTD1-206ENST00000591270 2163 ntTSL 25.4□□□□□ -1.553e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.573e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 PIK3CA-203ENST00000468036 620 ntTSL 35.26□□□□□ -1.573e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 SRP19-203ENST00000504696 473 ntTSL 25.21□□□□□ -1.583e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 ATXN10-207ENST00000470722 391 ntTSL 34.72□□□□□ -1.653e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 SRP19-205ENST00000506987 727 ntTSL 23.89□□□□□ -1.793e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 UBR1-211ENST00000569971 721 ntTSL 43.65□□□□□ -1.833e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 CLOCK-206ENST00000506923 616 ntTSL 33.63□□□□□ -1.833e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 HERC1-215ENST00000561436 551 ntTSL 43.18□□□□□ -1.91e-8■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 CDC42BPA-212ENST00000478573 599 ntTSL 53.17□□□□□ -1.91e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.913e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 ATP6V1C1-204ENST00000518959 553 ntTSL 22.74□□□□□ -1.973e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 CLOCK-205ENST00000506747 1337 ntTSL 1 (best)2.62□□□□□ -1.993e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 ACADSB-203ENST00000411816 512 ntTSL 32.6□□□□□ -1.993e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 C5-205ENST00000489802 382 ntTSL 32.48□□□□□ -2.013e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 PUS7L-204ENST00000547156 566 ntTSL 52.06□□□□□ -2.083e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 PUS7L-206ENST00000550784 677 ntTSL 41.64□□□□□ -2.153e-6■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 WWP1-206ENST00000520521 556 ntTSL 44.28□□□□□ -1.722e-10■■■■■ 26.9
U2AF2P26368 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.484e-7■■■■■ 26.8
U2AF2P26368 KATNBL1-216ENST00000561270 884 ntTSL 24.09□□□□□ -1.754e-7■■■■■ 26.8
U2AF2P26368 ACSF2-212ENST00000507769 595 ntTSL 319.84■□□□□ 0.772e-9■■■■■ 26.8
U2AF2P26368 ACSF2-224ENST00000513544 497 ntTSL 518.88■□□□□ 0.612e-9■■■■■ 26.8
U2AF2P26368 ACSF2-221ENST00000512119 598 ntTSL 315.94■□□□□ 0.142e-9■■■■■ 26.8
U2AF2P26368 ACSF2-205ENST00000503387 559 ntTSL 415.73■□□□□ 0.112e-9■■■■■ 26.8
U2AF2P26368 ACSF2-220ENST00000511288 838 ntTSL 1 (best)15.62■□□□□ 0.092e-9■■■■■ 26.8
U2AF2P26368 ACSF2-215ENST00000508734 165 ntTSL 514.29□□□□□ -0.122e-9■■■■■ 26.8
U2AF2P26368 ACSF2-214ENST00000508245 665 ntTSL 513.64□□□□□ -0.232e-9■■■■■ 26.8
U2AF2P26368 ACSF2-216ENST00000509806 706 ntTSL 313.29□□□□□ -0.282e-9■■■■■ 26.8
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