Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM3P25205 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM3P25205 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM3P25205 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM3P25205 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM3P25205 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM3P25205 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM3P25205 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM3P25205 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM3P25205 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM3P25205 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM3P25205 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM3P25205 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM3P25205 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM3P25205 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM3P25205 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM3P25205 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM3P25205 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM3P25205 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM3P25205 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM3P25205 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM3P25205 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM3P25205 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM3P25205 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM3P25205 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM3P25205 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM3P25205 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM3P25205 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM3P25205 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM3P25205 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM3P25205 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM3P25205 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM3P25205 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM3P25205 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCM3P25205 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM3P25205 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM3P25205 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM3P25205 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM3P25205 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM3P25205 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM3P25205 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM3P25205 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM3P25205 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM3P25205 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM3P25205 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM3P25205 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM3P25205 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM3P25205 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM3P25205 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM3P25205 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM3P25205 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM3P25205 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM3P25205 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM3P25205 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM3P25205 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM3P25205 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM3P25205 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM3P25205 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM3P25205 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM3P25205 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCM3P25205 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCM3P25205 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCM3P25205 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCM3P25205 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCM3P25205 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCM3P25205 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCM3P25205 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCM3P25205 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCM3P25205 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCM3P25205 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCM3P25205 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCM3P25205 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCM3P25205 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCM3P25205 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCM3P25205 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCM3P25205 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCM3P25205 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCM3P25205 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCM3P25205 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCM3P25205 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCM3P25205 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCM3P25205 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCM3P25205 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCM3P25205 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCM3P25205 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCM3P25205 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCM3P25205 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCM3P25205 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCM3P25205 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCM3P25205 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MCM3P25205 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MCM3P25205 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCM3P25205 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCM3P25205 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCM3P25205 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCM3P25205 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCM3P25205 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCM3P25205 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCM3P25205 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCM3P25205 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms