Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms