Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRDP23468 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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