Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCSHP23434 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCSHP23434 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCSHP23434 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCSHP23434 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCSHP23434 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCSHP23434 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCSHP23434 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCSHP23434 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCSHP23434 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCSHP23434 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCSHP23434 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCSHP23434 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCSHP23434 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCSHP23434 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCSHP23434 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCSHP23434 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCSHP23434 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GCSHP23434 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSHP23434 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSHP23434 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSHP23434 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSHP23434 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSHP23434 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSHP23434 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSHP23434 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSHP23434 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSHP23434 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSHP23434 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSHP23434 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSHP23434 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSHP23434 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSHP23434 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSHP23434 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSHP23434 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSHP23434 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSHP23434 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSHP23434 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSHP23434 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GCSHP23434 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSHP23434 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSHP23434 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSHP23434 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSHP23434 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSHP23434 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSHP23434 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSHP23434 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSHP23434 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSHP23434 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSHP23434 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSHP23434 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSHP23434 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSHP23434 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSHP23434 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSHP23434 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSHP23434 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSHP23434 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSHP23434 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSHP23434 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSHP23434 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSHP23434 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCSHP23434 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSHP23434 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSHP23434 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSHP23434 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSHP23434 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSHP23434 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSHP23434 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSHP23434 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSHP23434 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSHP23434 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSHP23434 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSHP23434 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSHP23434 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSHP23434 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSHP23434 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSHP23434 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSHP23434 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSHP23434 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSHP23434 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSHP23434 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSHP23434 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSHP23434 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSHP23434 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSHP23434 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCSHP23434 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GCSHP23434 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GCSHP23434 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCSHP23434 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCSHP23434 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCSHP23434 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCSHP23434 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCSHP23434 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCSHP23434 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCSHP23434 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCSHP23434 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCSHP23434 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCSHP23434 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCSHP23434 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCSHP23434 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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