Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms