Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms