Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL17P18621 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL17P18621 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL17P18621 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL17P18621 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL17P18621 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL17P18621 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL17P18621 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL17P18621 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL17P18621 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL17P18621 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL17P18621 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL17P18621 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL17P18621 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL17P18621 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL17P18621 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL17P18621 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL17P18621 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL17P18621 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL17P18621 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL17P18621 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL17P18621 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL17P18621 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL17P18621 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL17P18621 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL17P18621 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPL17P18621 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL17P18621 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL17P18621 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL17P18621 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL17P18621 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL17P18621 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL17P18621 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL17P18621 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL17P18621 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL17P18621 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL17P18621 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL17P18621 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL17P18621 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL17P18621 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL17P18621 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL17P18621 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL17P18621 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL17P18621 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL17P18621 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL17P18621 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL17P18621 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL17P18621 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL17P18621 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL17P18621 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL17P18621 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL17P18621 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL17P18621 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL17P18621 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL17P18621 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL17P18621 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL17P18621 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL17P18621 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL17P18621 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL17P18621 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL17P18621 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL17P18621 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL17P18621 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL17P18621 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL17P18621 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL17P18621 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL17P18621 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL17P18621 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL17P18621 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL17P18621 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL17P18621 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL17P18621 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL17P18621 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL17P18621 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL17P18621 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL17P18621 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL17P18621 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL17P18621 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL17P18621 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL17P18621 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL17P18621 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL17P18621 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL17P18621 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL17P18621 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL17P18621 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL17P18621 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL17P18621 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL17P18621 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL17P18621 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL17P18621 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL17P18621 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL17P18621 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL17P18621 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL17P18621 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL17P18621 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL17P18621 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL17P18621 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL17P18621 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL17P18621 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL17P18621 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms