Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB1P16220 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB1P16220 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB1P16220 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB1P16220 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB1P16220 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB1P16220 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB1P16220 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB1P16220 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB1P16220 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB1P16220 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB1P16220 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB1P16220 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB1P16220 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB1P16220 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB1P16220 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB1P16220 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB1P16220 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB1P16220 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB1P16220 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB1P16220 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB1P16220 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB1P16220 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB1P16220 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB1P16220 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB1P16220 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB1P16220 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB1P16220 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB1P16220 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB1P16220 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB1P16220 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB1P16220 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB1P16220 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB1P16220 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB1P16220 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREB1P16220 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREB1P16220 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREB1P16220 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREB1P16220 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREB1P16220 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREB1P16220 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREB1P16220 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREB1P16220 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB1P16220 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB1P16220 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB1P16220 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB1P16220 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB1P16220 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB1P16220 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB1P16220 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB1P16220 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB1P16220 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB1P16220 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB1P16220 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB1P16220 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB1P16220 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB1P16220 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB1P16220 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB1P16220 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB1P16220 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB1P16220 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB1P16220 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB1P16220 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB1P16220 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB1P16220 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB1P16220 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB1P16220 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB1P16220 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB1P16220 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB1P16220 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB1P16220 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB1P16220 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB1P16220 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB1P16220 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB1P16220 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB1P16220 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB1P16220 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB1P16220 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB1P16220 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB1P16220 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB1P16220 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB1P16220 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB1P16220 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB1P16220 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB1P16220 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB1P16220 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB1P16220 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB1P16220 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB1P16220 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB1P16220 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB1P16220 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB1P16220 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB1P16220 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB1P16220 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB1P16220 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB1P16220 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CREB1P16220 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CREB1P16220 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CREB1P16220 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CREB1P16220 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms