Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-DOBP13765 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms