Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BMP3P12645 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BMP3P12645 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BMP3P12645 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BMP3P12645 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BMP3P12645 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BMP3P12645 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
BMP3P12645 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BMP3P12645 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BMP3P12645 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
BMP3P12645 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BMP3P12645 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BMP3P12645 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BMP3P12645 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BMP3P12645 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BMP3P12645 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BMP3P12645 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BMP3P12645 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BMP3P12645 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BMP3P12645 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BMP3P12645 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BMP3P12645 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BMP3P12645 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BMP3P12645 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BMP3P12645 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BMP3P12645 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BMP3P12645 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BMP3P12645 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BMP3P12645 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BMP3P12645 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BMP3P12645 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BMP3P12645 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BMP3P12645 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BMP3P12645 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BMP3P12645 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BMP3P12645 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
BMP3P12645 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BMP3P12645 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BMP3P12645 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BMP3P12645 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BMP3P12645 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BMP3P12645 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BMP3P12645 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
BMP3P12645 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BMP3P12645 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BMP3P12645 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
BMP3P12645 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BMP3P12645 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BMP3P12645 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BMP3P12645 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BMP3P12645 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BMP3P12645 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BMP3P12645 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BMP3P12645 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BMP3P12645 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BMP3P12645 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BMP3P12645 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BMP3P12645 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BMP3P12645 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BMP3P12645 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BMP3P12645 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BMP3P12645 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BMP3P12645 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BMP3P12645 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BMP3P12645 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BMP3P12645 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BMP3P12645 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BMP3P12645 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BMP3P12645 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BMP3P12645 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BMP3P12645 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BMP3P12645 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BMP3P12645 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BMP3P12645 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BMP3P12645 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
BMP3P12645 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BMP3P12645 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BMP3P12645 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BMP3P12645 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BMP3P12645 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BMP3P12645 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BMP3P12645 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BMP3P12645 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BMP3P12645 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BMP3P12645 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BMP3P12645 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BMP3P12645 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BMP3P12645 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BMP3P12645 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BMP3P12645 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BMP3P12645 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BMP3P12645 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BMP3P12645 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BMP3P12645 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BMP3P12645 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BMP3P12645 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BMP3P12645 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BMP3P12645 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BMP3P12645 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BMP3P12645 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms