Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NEFHP12036 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEFHP12036 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEFHP12036 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEFHP12036 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEFHP12036 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEFHP12036 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEFHP12036 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NEFHP12036 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEFHP12036 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NEFHP12036 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NEFHP12036 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEFHP12036 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEFHP12036 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NEFHP12036 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NEFHP12036 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NEFHP12036 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NEFHP12036 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NEFHP12036 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NEFHP12036 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFHP12036 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFHP12036 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFHP12036 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFHP12036 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFHP12036 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFHP12036 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFHP12036 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFHP12036 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFHP12036 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFHP12036 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFHP12036 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFHP12036 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFHP12036 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFHP12036 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFHP12036 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFHP12036 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFHP12036 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFHP12036 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFHP12036 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFHP12036 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEFHP12036 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEFHP12036 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEFHP12036 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEFHP12036 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEFHP12036 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEFHP12036 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEFHP12036 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEFHP12036 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEFHP12036 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEFHP12036 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEFHP12036 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEFHP12036 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEFHP12036 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEFHP12036 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEFHP12036 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEFHP12036 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEFHP12036 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEFHP12036 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NEFHP12036 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEFHP12036 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEFHP12036 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEFHP12036 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEFHP12036 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEFHP12036 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEFHP12036 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEFHP12036 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEFHP12036 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFHP12036 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFHP12036 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFHP12036 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFHP12036 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFHP12036 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFHP12036 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFHP12036 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFHP12036 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFHP12036 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFHP12036 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFHP12036 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFHP12036 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFHP12036 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFHP12036 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFHP12036 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFHP12036 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFHP12036 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEFHP12036 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEFHP12036 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NEFHP12036 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEFHP12036 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEFHP12036 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEFHP12036 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEFHP12036 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEFHP12036 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEFHP12036 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEFHP12036 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEFHP12036 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEFHP12036 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEFHP12036 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEFHP12036 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NEFHP12036 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEFHP12036 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms