Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT3P12035 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT3P12035 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT3P12035 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT3P12035 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT3P12035 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT3P12035 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT3P12035 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT3P12035 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT3P12035 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT3P12035 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT3P12035 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT3P12035 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT3P12035 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT3P12035 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT3P12035 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT3P12035 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT3P12035 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT3P12035 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT3P12035 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT3P12035 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT3P12035 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT3P12035 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT3P12035 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT3P12035 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT3P12035 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT3P12035 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT3P12035 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT3P12035 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT3P12035 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT3P12035 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT3P12035 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT3P12035 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT3P12035 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT3P12035 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT3P12035 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT3P12035 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT3P12035 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT3P12035 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT3P12035 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT3P12035 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT3P12035 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT3P12035 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT3P12035 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT3P12035 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT3P12035 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT3P12035 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT3P12035 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT3P12035 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT3P12035 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT3P12035 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT3P12035 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT3P12035 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT3P12035 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT3P12035 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT3P12035 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT3P12035 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT3P12035 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT3P12035 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT3P12035 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT3P12035 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT3P12035 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT3P12035 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT3P12035 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT3P12035 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT3P12035 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT3P12035 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT3P12035 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT3P12035 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT3P12035 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT3P12035 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT3P12035 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT3P12035 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT3P12035 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT3P12035 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT3P12035 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT3P12035 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT3P12035 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT3P12035 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT3P12035 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT3P12035 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT3P12035 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT3P12035 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT3P12035 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT3P12035 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT3P12035 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT3P12035 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT3P12035 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT3P12035 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT3P12035 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT3P12035 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT3P12035 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT3P12035 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT3P12035 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT3P12035 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT3P12035 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT3P12035 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT3P12035 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT3P12035 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT3P12035 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms