Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GLI3P10071 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GLI3P10071 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GLI3P10071 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GLI3P10071 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GLI3P10071 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GLI3P10071 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GLI3P10071 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GLI3P10071 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GLI3P10071 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GLI3P10071 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GLI3P10071 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GLI3P10071 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GLI3P10071 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GLI3P10071 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GLI3P10071 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GLI3P10071 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GLI3P10071 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GLI3P10071 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GLI3P10071 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GLI3P10071 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GLI3P10071 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GLI3P10071 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GLI3P10071 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GLI3P10071 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
GLI3P10071 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GLI3P10071 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
GLI3P10071 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GLI3P10071 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GLI3P10071 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
GLI3P10071 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GLI3P10071 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GLI3P10071 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GLI3P10071 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GLI3P10071 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GLI3P10071 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
GLI3P10071 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GLI3P10071 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
GLI3P10071 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GLI3P10071 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GLI3P10071 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
GLI3P10071 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GLI3P10071 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GLI3P10071 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GLI3P10071 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GLI3P10071 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GLI3P10071 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GLI3P10071 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GLI3P10071 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GLI3P10071 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GLI3P10071 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GLI3P10071 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GLI3P10071 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GLI3P10071 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GLI3P10071 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GLI3P10071 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GLI3P10071 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GLI3P10071 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GLI3P10071 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GLI3P10071 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GLI3P10071 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GLI3P10071 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GLI3P10071 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GLI3P10071 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GLI3P10071 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GLI3P10071 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GLI3P10071 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GLI3P10071 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GLI3P10071 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GLI3P10071 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
GLI3P10071 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GLI3P10071 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
GLI3P10071 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
GLI3P10071 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GLI3P10071 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GLI3P10071 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GLI3P10071 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GLI3P10071 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GLI3P10071 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GLI3P10071 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GLI3P10071 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GLI3P10071 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GLI3P10071 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GLI3P10071 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
GLI3P10071 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GLI3P10071 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GLI3P10071 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GLI3P10071 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GLI3P10071 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GLI3P10071 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
GLI3P10071 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GLI3P10071 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GLI3P10071 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GLI3P10071 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GLI3P10071 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GLI3P10071 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GLI3P10071 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GLI3P10071 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GLI3P10071 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GLI3P10071 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms