Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GLI2P10070 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GLI2P10070 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GLI2P10070 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GLI2P10070 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GLI2P10070 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GLI2P10070 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GLI2P10070 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
GLI2P10070 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
GLI2P10070 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GLI2P10070 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GLI2P10070 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GLI2P10070 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GLI2P10070 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GLI2P10070 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
GLI2P10070 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GLI2P10070 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GLI2P10070 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GLI2P10070 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GLI2P10070 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GLI2P10070 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
GLI2P10070 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
GLI2P10070 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
GLI2P10070 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
GLI2P10070 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
GLI2P10070 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
GLI2P10070 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
GLI2P10070 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
GLI2P10070 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
GLI2P10070 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
GLI2P10070 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
GLI2P10070 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
GLI2P10070 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC32.7■■■□□ 2.83
GLI2P10070 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC32.7■■■□□ 2.83
GLI2P10070 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
GLI2P10070 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GLI2P10070 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
GLI2P10070 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GLI2P10070 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GLI2P10070 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GLI2P10070 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
GLI2P10070 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
GLI2P10070 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
GLI2P10070 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
GLI2P10070 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
GLI2P10070 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
GLI2P10070 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
GLI2P10070 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
GLI2P10070 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
GLI2P10070 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
GLI2P10070 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
GLI2P10070 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
GLI2P10070 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
GLI2P10070 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
GLI2P10070 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
GLI2P10070 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
GLI2P10070 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
GLI2P10070 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
GLI2P10070 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GLI2P10070 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GLI2P10070 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GLI2P10070 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GLI2P10070 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GLI2P10070 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GLI2P10070 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GLI2P10070 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
GLI2P10070 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
GLI2P10070 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GLI2P10070 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GLI2P10070 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GLI2P10070 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
GLI2P10070 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
GLI2P10070 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
GLI2P10070 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
GLI2P10070 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
GLI2P10070 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
GLI2P10070 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
GLI2P10070 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
GLI2P10070 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
GLI2P10070 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
GLI2P10070 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
GLI2P10070 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
GLI2P10070 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
GLI2P10070 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
GLI2P10070 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
GLI2P10070 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
GLI2P10070 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
GLI2P10070 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
GLI2P10070 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
GLI2P10070 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
GLI2P10070 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
GLI2P10070 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
GLI2P10070 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
GLI2P10070 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
GLI2P10070 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
GLI2P10070 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
GLI2P10070 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
GLI2P10070 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
GLI2P10070 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
GLI2P10070 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms