Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms