Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms