Protein–RNA interactions for Protein: P0CG21

NHLRC4, NHL-repeat-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC4P0CG21 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC4P0CG21 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC4P0CG21 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms