Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC172P0C7W6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC172P0C7W6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms