Protein–RNA interactions for Protein: P06858

LPL, Lipoprotein lipase, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPLP06858 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LPLP06858 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LPLP06858 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LPLP06858 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LPLP06858 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LPLP06858 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LPLP06858 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LPLP06858 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LPLP06858 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LPLP06858 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LPLP06858 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LPLP06858 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LPLP06858 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LPLP06858 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LPLP06858 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LPLP06858 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LPLP06858 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LPLP06858 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LPLP06858 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LPLP06858 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LPLP06858 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LPLP06858 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LPLP06858 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LPLP06858 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LPLP06858 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LPLP06858 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LPLP06858 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LPLP06858 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LPLP06858 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LPLP06858 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LPLP06858 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LPLP06858 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LPLP06858 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LPLP06858 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LPLP06858 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LPLP06858 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LPLP06858 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LPLP06858 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LPLP06858 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LPLP06858 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LPLP06858 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LPLP06858 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LPLP06858 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LPLP06858 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LPLP06858 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LPLP06858 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LPLP06858 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LPLP06858 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LPLP06858 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LPLP06858 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LPLP06858 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LPLP06858 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LPLP06858 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LPLP06858 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPLP06858 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPLP06858 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPLP06858 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPLP06858 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPLP06858 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPLP06858 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPLP06858 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPLP06858 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPLP06858 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPLP06858 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPLP06858 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPLP06858 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPLP06858 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPLP06858 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPLP06858 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPLP06858 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPLP06858 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPLP06858 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPLP06858 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPLP06858 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPLP06858 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPLP06858 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPLP06858 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPLP06858 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPLP06858 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPLP06858 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPLP06858 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LPLP06858 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPLP06858 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPLP06858 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPLP06858 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPLP06858 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPLP06858 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPLP06858 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPLP06858 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPLP06858 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPLP06858 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPLP06858 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPLP06858 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPLP06858 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPLP06858 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPLP06858 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPLP06858 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LPLP06858 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPLP06858 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPLP06858 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms