Protein–RNA interactions for Protein: P05937

CALB1, Calbindin, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB1P05937 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALB1P05937 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALB1P05937 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALB1P05937 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALB1P05937 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALB1P05937 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALB1P05937 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALB1P05937 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALB1P05937 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALB1P05937 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALB1P05937 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALB1P05937 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALB1P05937 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALB1P05937 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALB1P05937 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALB1P05937 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALB1P05937 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALB1P05937 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALB1P05937 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CALB1P05937 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALB1P05937 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALB1P05937 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALB1P05937 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALB1P05937 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALB1P05937 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALB1P05937 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALB1P05937 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALB1P05937 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALB1P05937 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALB1P05937 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALB1P05937 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALB1P05937 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALB1P05937 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALB1P05937 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALB1P05937 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALB1P05937 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALB1P05937 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALB1P05937 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALB1P05937 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALB1P05937 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALB1P05937 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALB1P05937 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CALB1P05937 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALB1P05937 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALB1P05937 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CALB1P05937 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALB1P05937 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALB1P05937 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALB1P05937 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALB1P05937 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALB1P05937 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALB1P05937 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALB1P05937 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALB1P05937 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALB1P05937 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALB1P05937 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALB1P05937 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALB1P05937 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALB1P05937 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALB1P05937 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALB1P05937 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALB1P05937 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALB1P05937 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALB1P05937 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALB1P05937 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALB1P05937 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALB1P05937 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALB1P05937 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALB1P05937 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALB1P05937 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CALB1P05937 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALB1P05937 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALB1P05937 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALB1P05937 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALB1P05937 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALB1P05937 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALB1P05937 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALB1P05937 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALB1P05937 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALB1P05937 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALB1P05937 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALB1P05937 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALB1P05937 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALB1P05937 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CALB1P05937 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALB1P05937 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALB1P05937 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CALB1P05937 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALB1P05937 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALB1P05937 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALB1P05937 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALB1P05937 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALB1P05937 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALB1P05937 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALB1P05937 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALB1P05937 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALB1P05937 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALB1P05937 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALB1P05937 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALB1P05937 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms