Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOA1P02647 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOA1P02647 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOA1P02647 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOA1P02647 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOA1P02647 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOA1P02647 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOA1P02647 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOA1P02647 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOA1P02647 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOA1P02647 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOA1P02647 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOA1P02647 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOA1P02647 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOA1P02647 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOA1P02647 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOA1P02647 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOA1P02647 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOA1P02647 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOA1P02647 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOA1P02647 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOA1P02647 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOA1P02647 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOA1P02647 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOA1P02647 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOA1P02647 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOA1P02647 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOA1P02647 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOA1P02647 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOA1P02647 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOA1P02647 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOA1P02647 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOA1P02647 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOA1P02647 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOA1P02647 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOA1P02647 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOA1P02647 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOA1P02647 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
APOA1P02647 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOA1P02647 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
APOA1P02647 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOA1P02647 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOA1P02647 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOA1P02647 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOA1P02647 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOA1P02647 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOA1P02647 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOA1P02647 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOA1P02647 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOA1P02647 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOA1P02647 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOA1P02647 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOA1P02647 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOA1P02647 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOA1P02647 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOA1P02647 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOA1P02647 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOA1P02647 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOA1P02647 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOA1P02647 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOA1P02647 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOA1P02647 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOA1P02647 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOA1P02647 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOA1P02647 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOA1P02647 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOA1P02647 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOA1P02647 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOA1P02647 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOA1P02647 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
APOA1P02647 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOA1P02647 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOA1P02647 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOA1P02647 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOA1P02647 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOA1P02647 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOA1P02647 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOA1P02647 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
APOA1P02647 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOA1P02647 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOA1P02647 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOA1P02647 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
APOA1P02647 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
APOA1P02647 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
APOA1P02647 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOA1P02647 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOA1P02647 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOA1P02647 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOA1P02647 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOA1P02647 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOA1P02647 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOA1P02647 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOA1P02647 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOA1P02647 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOA1P02647 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOA1P02647 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOA1P02647 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOA1P02647 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOA1P02647 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOA1P02647 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms