Protein–RNA interactions for Protein: P02462

COL4A1, Collagen alpha-1(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A1P02462 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
COL4A1P02462 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL4A1P02462 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL4A1P02462 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
COL4A1P02462 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL4A1P02462 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL4A1P02462 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
COL4A1P02462 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL4A1P02462 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL4A1P02462 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL4A1P02462 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
COL4A1P02462 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL4A1P02462 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
COL4A1P02462 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL4A1P02462 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL4A1P02462 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
COL4A1P02462 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
COL4A1P02462 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COL4A1P02462 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A1P02462 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A1P02462 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A1P02462 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A1P02462 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A1P02462 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A1P02462 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A1P02462 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A1P02462 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A1P02462 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A1P02462 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A1P02462 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A1P02462 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A1P02462 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A1P02462 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A1P02462 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms