Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-HP01893 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-HP01893 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-HP01893 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-HP01893 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-HP01893 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-HP01893 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-HP01893 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-HP01893 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-HP01893 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-HP01893 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-HP01893 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-HP01893 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-HP01893 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-HP01893 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-HP01893 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-HP01893 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-HP01893 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-HP01893 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-HP01893 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-HP01893 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-HP01893 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-HP01893 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-HP01893 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-HP01893 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-HP01893 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-HP01893 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-HP01893 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-HP01893 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-HP01893 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-HP01893 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-HP01893 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-HP01893 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms