Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms