Protein–RNA interactions for Protein: O95989

NUDT3, Diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT3O95989 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUDT3O95989 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms