Protein–RNA interactions for Protein: O95721

SNAP29, Synaptosomal-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP29O95721 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNAP29O95721 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNAP29O95721 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNAP29O95721 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNAP29O95721 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNAP29O95721 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNAP29O95721 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNAP29O95721 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNAP29O95721 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNAP29O95721 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNAP29O95721 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNAP29O95721 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNAP29O95721 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAP29O95721 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAP29O95721 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAP29O95721 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAP29O95721 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAP29O95721 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAP29O95721 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAP29O95721 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAP29O95721 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAP29O95721 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAP29O95721 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAP29O95721 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAP29O95721 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAP29O95721 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAP29O95721 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms