Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC30.87■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC30.87■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC30.85■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
POLR1AO95602 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
POLR1AO95602 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms