Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms