Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATG12O94817 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATG12O94817 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATG12O94817 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG12O94817 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG12O94817 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG12O94817 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG12O94817 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG12O94817 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG12O94817 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG12O94817 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG12O94817 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG12O94817 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG12O94817 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG12O94817 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG12O94817 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG12O94817 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG12O94817 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG12O94817 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG12O94817 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG12O94817 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG12O94817 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG12O94817 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG12O94817 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG12O94817 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG12O94817 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG12O94817 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG12O94817 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG12O94817 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG12O94817 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG12O94817 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG12O94817 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG12O94817 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG12O94817 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG12O94817 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG12O94817 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG12O94817 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG12O94817 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG12O94817 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG12O94817 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG12O94817 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG12O94817 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG12O94817 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG12O94817 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG12O94817 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG12O94817 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG12O94817 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG12O94817 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG12O94817 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG12O94817 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG12O94817 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG12O94817 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG12O94817 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG12O94817 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG12O94817 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG12O94817 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG12O94817 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG12O94817 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG12O94817 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG12O94817 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG12O94817 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG12O94817 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG12O94817 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG12O94817 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG12O94817 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG12O94817 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG12O94817 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG12O94817 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG12O94817 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG12O94817 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG12O94817 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG12O94817 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG12O94817 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG12O94817 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG12O94817 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG12O94817 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG12O94817 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG12O94817 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG12O94817 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG12O94817 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG12O94817 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG12O94817 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG12O94817 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG12O94817 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG12O94817 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG12O94817 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG12O94817 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG12O94817 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG12O94817 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG12O94817 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG12O94817 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG12O94817 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG12O94817 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG12O94817 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG12O94817 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG12O94817 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG12O94817 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG12O94817 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG12O94817 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG12O94817 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms