Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ECM2O94769 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ECM2O94769 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ECM2O94769 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ECM2O94769 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ECM2O94769 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ECM2O94769 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ECM2O94769 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ECM2O94769 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ECM2O94769 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ECM2O94769 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ECM2O94769 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ECM2O94769 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ECM2O94769 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ECM2O94769 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ECM2O94769 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM2O94769 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM2O94769 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM2O94769 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM2O94769 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM2O94769 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM2O94769 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM2O94769 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM2O94769 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM2O94769 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM2O94769 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM2O94769 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM2O94769 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM2O94769 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM2O94769 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECM2O94769 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECM2O94769 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECM2O94769 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECM2O94769 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECM2O94769 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECM2O94769 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ECM2O94769 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECM2O94769 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECM2O94769 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECM2O94769 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECM2O94769 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECM2O94769 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ECM2O94769 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ECM2O94769 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ECM2O94769 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ECM2O94769 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ECM2O94769 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ECM2O94769 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ECM2O94769 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ECM2O94769 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ECM2O94769 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ECM2O94769 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ECM2O94769 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ECM2O94769 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ECM2O94769 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ECM2O94769 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECM2O94769 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECM2O94769 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECM2O94769 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECM2O94769 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECM2O94769 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECM2O94769 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECM2O94769 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ECM2O94769 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECM2O94769 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECM2O94769 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECM2O94769 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECM2O94769 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECM2O94769 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECM2O94769 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECM2O94769 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECM2O94769 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECM2O94769 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECM2O94769 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECM2O94769 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ECM2O94769 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ECM2O94769 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ECM2O94769 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ECM2O94769 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ECM2O94769 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ECM2O94769 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ECM2O94769 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ECM2O94769 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ECM2O94769 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ECM2O94769 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ECM2O94769 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ECM2O94769 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ECM2O94769 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ECM2O94769 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECM2O94769 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECM2O94769 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECM2O94769 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECM2O94769 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECM2O94769 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECM2O94769 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECM2O94769 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECM2O94769 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECM2O94769 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECM2O94769 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECM2O94769 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms