Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NIPSNAP2O75323 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NIPSNAP2O75323 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms