Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH6O60337 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH6O60337 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms