Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIAH2O43255 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIAH2O43255 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms