Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms