Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUPL2O15504 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms