Protein–RNA interactions for Protein: O14896

IRF6, Interferon regulatory factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF6O14896 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRF6O14896 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRF6O14896 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRF6O14896 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRF6O14896 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRF6O14896 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRF6O14896 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRF6O14896 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRF6O14896 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRF6O14896 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRF6O14896 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRF6O14896 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF6O14896 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF6O14896 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF6O14896 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF6O14896 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF6O14896 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF6O14896 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF6O14896 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF6O14896 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF6O14896 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF6O14896 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF6O14896 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF6O14896 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF6O14896 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF6O14896 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRF6O14896 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRF6O14896 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRF6O14896 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRF6O14896 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRF6O14896 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRF6O14896 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRF6O14896 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRF6O14896 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRF6O14896 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRF6O14896 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRF6O14896 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRF6O14896 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRF6O14896 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRF6O14896 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRF6O14896 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRF6O14896 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRF6O14896 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRF6O14896 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
IRF6O14896 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRF6O14896 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRF6O14896 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRF6O14896 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRF6O14896 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRF6O14896 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRF6O14896 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRF6O14896 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRF6O14896 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRF6O14896 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF6O14896 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF6O14896 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF6O14896 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF6O14896 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF6O14896 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF6O14896 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF6O14896 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF6O14896 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF6O14896 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF6O14896 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF6O14896 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF6O14896 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF6O14896 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF6O14896 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF6O14896 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF6O14896 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF6O14896 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF6O14896 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF6O14896 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF6O14896 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRF6O14896 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRF6O14896 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRF6O14896 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
IRF6O14896 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRF6O14896 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRF6O14896 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRF6O14896 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRF6O14896 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRF6O14896 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRF6O14896 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRF6O14896 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRF6O14896 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRF6O14896 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRF6O14896 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRF6O14896 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRF6O14896 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRF6O14896 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRF6O14896 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRF6O14896 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRF6O14896 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRF6O14896 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRF6O14896 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRF6O14896 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRF6O14896 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRF6O14896 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRF6O14896 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms