Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
APAF1O14727 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
APAF1O14727 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
APAF1O14727 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
APAF1O14727 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
APAF1O14727 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
APAF1O14727 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
APAF1O14727 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
APAF1O14727 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
APAF1O14727 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
APAF1O14727 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
APAF1O14727 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
APAF1O14727 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
APAF1O14727 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
APAF1O14727 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
APAF1O14727 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
APAF1O14727 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
APAF1O14727 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
APAF1O14727 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
APAF1O14727 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
APAF1O14727 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
APAF1O14727 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
APAF1O14727 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
APAF1O14727 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
APAF1O14727 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
APAF1O14727 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
APAF1O14727 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
APAF1O14727 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
APAF1O14727 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
APAF1O14727 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
APAF1O14727 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
APAF1O14727 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
APAF1O14727 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
APAF1O14727 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
APAF1O14727 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
APAF1O14727 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
APAF1O14727 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
APAF1O14727 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
APAF1O14727 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
APAF1O14727 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
APAF1O14727 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
APAF1O14727 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
APAF1O14727 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
APAF1O14727 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
APAF1O14727 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
APAF1O14727 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
APAF1O14727 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
APAF1O14727 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
APAF1O14727 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
APAF1O14727 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
APAF1O14727 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
APAF1O14727 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
APAF1O14727 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
APAF1O14727 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
APAF1O14727 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
APAF1O14727 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
APAF1O14727 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
APAF1O14727 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
APAF1O14727 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
APAF1O14727 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
APAF1O14727 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
APAF1O14727 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
APAF1O14727 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
APAF1O14727 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
APAF1O14727 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
APAF1O14727 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
APAF1O14727 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
APAF1O14727 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
APAF1O14727 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
APAF1O14727 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
APAF1O14727 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
APAF1O14727 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
APAF1O14727 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
APAF1O14727 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
APAF1O14727 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
APAF1O14727 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
APAF1O14727 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
APAF1O14727 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
APAF1O14727 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
APAF1O14727 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
APAF1O14727 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
APAF1O14727 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
APAF1O14727 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
APAF1O14727 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
APAF1O14727 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
APAF1O14727 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
APAF1O14727 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
APAF1O14727 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
APAF1O14727 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
APAF1O14727 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
APAF1O14727 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
APAF1O14727 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
APAF1O14727 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
APAF1O14727 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
APAF1O14727 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
APAF1O14727 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
APAF1O14727 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
APAF1O14727 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
APAF1O14727 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
APAF1O14727 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms