Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HIP1O00291 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HIP1O00291 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HIP1O00291 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIP1O00291 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIP1O00291 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIP1O00291 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIP1O00291 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIP1O00291 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIP1O00291 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIP1O00291 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIP1O00291 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIP1O00291 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIP1O00291 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HIP1O00291 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIP1O00291 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIP1O00291 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIP1O00291 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIP1O00291 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIP1O00291 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HIP1O00291 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HIP1O00291 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HIP1O00291 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HIP1O00291 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HIP1O00291 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HIP1O00291 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HIP1O00291 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HIP1O00291 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HIP1O00291 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIP1O00291 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIP1O00291 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIP1O00291 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIP1O00291 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIP1O00291 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIP1O00291 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIP1O00291 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIP1O00291 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIP1O00291 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIP1O00291 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIP1O00291 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIP1O00291 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIP1O00291 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIP1O00291 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIP1O00291 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIP1O00291 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HIP1O00291 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIP1O00291 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIP1O00291 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIP1O00291 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIP1O00291 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIP1O00291 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIP1O00291 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIP1O00291 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIP1O00291 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIP1O00291 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIP1O00291 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIP1O00291 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIP1O00291 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIP1O00291 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIP1O00291 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIP1O00291 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIP1O00291 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIP1O00291 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIP1O00291 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIP1O00291 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIP1O00291 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIP1O00291 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HIP1O00291 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIP1O00291 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HIP1O00291 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HIP1O00291 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HIP1O00291 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HIP1O00291 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HIP1O00291 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HIP1O00291 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HIP1O00291 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HIP1O00291 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HIP1O00291 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HIP1O00291 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HIP1O00291 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HIP1O00291 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HIP1O00291 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HIP1O00291 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HIP1O00291 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HIP1O00291 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HIP1O00291 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HIP1O00291 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIP1O00291 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIP1O00291 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIP1O00291 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIP1O00291 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIP1O00291 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIP1O00291 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIP1O00291 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIP1O00291 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIP1O00291 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIP1O00291 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIP1O00291 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIP1O00291 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIP1O00291 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms