Protein–RNA interactions for Protein: O00212

RHOD, Rho-related GTP-binding protein RhoD, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHODO00212 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHODO00212 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHODO00212 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHODO00212 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHODO00212 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHODO00212 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHODO00212 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHODO00212 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHODO00212 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHODO00212 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHODO00212 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHODO00212 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHODO00212 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHODO00212 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHODO00212 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHODO00212 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHODO00212 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHODO00212 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHODO00212 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHODO00212 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RHODO00212 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHODO00212 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHODO00212 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHODO00212 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHODO00212 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHODO00212 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHODO00212 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHODO00212 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHODO00212 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHODO00212 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHODO00212 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHODO00212 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHODO00212 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHODO00212 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHODO00212 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHODO00212 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHODO00212 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHODO00212 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHODO00212 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RHODO00212 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHODO00212 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHODO00212 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHODO00212 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHODO00212 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHODO00212 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHODO00212 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHODO00212 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHODO00212 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHODO00212 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHODO00212 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHODO00212 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHODO00212 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHODO00212 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHODO00212 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHODO00212 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHODO00212 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHODO00212 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHODO00212 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RHODO00212 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHODO00212 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHODO00212 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHODO00212 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHODO00212 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHODO00212 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHODO00212 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHODO00212 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHODO00212 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHODO00212 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHODO00212 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHODO00212 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHODO00212 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHODO00212 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHODO00212 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHODO00212 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHODO00212 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHODO00212 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHODO00212 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHODO00212 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHODO00212 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHODO00212 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHODO00212 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHODO00212 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHODO00212 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHODO00212 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHODO00212 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHODO00212 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHODO00212 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHODO00212 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHODO00212 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHODO00212 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHODO00212 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHODO00212 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHODO00212 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHODO00212 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHODO00212 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHODO00212 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHODO00212 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHODO00212 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHODO00212 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHODO00212 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms