Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
J3KR12 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
J3KR12 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
J3KR12 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
J3KR12 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
J3KR12 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
J3KR12 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
J3KR12 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
J3KR12 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
J3KR12 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
J3KR12 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
J3KR12 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
J3KR12 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3KR12 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3KR12 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3KR12 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3KR12 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3KR12 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3KR12 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3KR12 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3KR12 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3KR12 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
J3KR12 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3KR12 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
J3KR12 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3KR12 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3KR12 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3KR12 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3KR12 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3KR12 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3KR12 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3KR12 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
J3KR12 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
J3KR12 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
J3KR12 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
J3KR12 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
J3KR12 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
J3KR12 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
J3KR12 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
J3KR12 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
J3KR12 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
J3KR12 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
J3KR12 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
J3KR12 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
J3KR12 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
J3KR12 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
J3KR12 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
J3KR12 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
J3KR12 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
J3KR12 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
J3KR12 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
J3KR12 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
J3KR12 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
J3KR12 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
J3KR12 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
J3KR12 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3KR12 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3KR12 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3KR12 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3KR12 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3KR12 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3KR12 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3KR12 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3KR12 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3KR12 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3KR12 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3KR12 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
J3KR12 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
J3KR12 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
J3KR12 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
J3KR12 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
J3KR12 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
J3KR12 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
J3KR12 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
J3KR12 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
J3KR12 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
J3KR12 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
J3KR12 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
J3KR12 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
J3KR12 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
J3KR12 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3KR12 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3KR12 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3KR12 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3KR12 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3KR12 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3KR12 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3KR12 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3KR12 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3KR12 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3KR12 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3KR12 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3KR12 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3KR12 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3KR12 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3KR12 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3KR12 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3KR12 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3KR12 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3KR12 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms