Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms