Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA8SH3BPF8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms