Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HMGB1P1B2RPK0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms