Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VGLL3A8MV65 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VGLL3A8MV65 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VGLL3A8MV65 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VGLL3A8MV65 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
VGLL3A8MV65 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
VGLL3A8MV65 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
VGLL3A8MV65 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
VGLL3A8MV65 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
VGLL3A8MV65 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VGLL3A8MV65 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms