Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP27XA6NNY8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms