Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF7

TMEM88B, Transmembrane protein 88B, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88BA6NKF7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM88BA6NKF7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM88BA6NKF7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM88BA6NKF7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM88BA6NKF7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM88BA6NKF7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM88BA6NKF7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM88BA6NKF7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM88BA6NKF7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM88BA6NKF7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM88BA6NKF7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM88BA6NKF7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM88BA6NKF7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM88BA6NKF7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM88BA6NKF7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM88BA6NKF7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM88BA6NKF7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM88BA6NKF7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM88BA6NKF7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM88BA6NKF7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM88BA6NKF7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM88BA6NKF7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM88BA6NKF7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM88BA6NKF7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms