Protein–RNA interactions for Protein: A6NIX2

WTIP, Wilms tumor protein 1-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WTIPA6NIX2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
WTIPA6NIX2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
WTIPA6NIX2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
WTIPA6NIX2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
WTIPA6NIX2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
WTIPA6NIX2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
WTIPA6NIX2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
WTIPA6NIX2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
WTIPA6NIX2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
WTIPA6NIX2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
WTIPA6NIX2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
WTIPA6NIX2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
WTIPA6NIX2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms