Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms