Protein–RNA interactions for Protein: A6NDI0

TRIM49B, Putative tripartite motif-containing protein 49B, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49BA6NDI0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM49BA6NDI0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM49BA6NDI0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM49BA6NDI0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM49BA6NDI0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM49BA6NDI0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM49BA6NDI0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM49BA6NDI0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM49BA6NDI0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM49BA6NDI0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM49BA6NDI0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM49BA6NDI0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM49BA6NDI0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM49BA6NDI0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM49BA6NDI0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM49BA6NDI0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM49BA6NDI0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM49BA6NDI0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM49BA6NDI0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms